※乗り入れ路線の分岐駅は地理的に判断しているため、設備上や乗り換え上の分岐と異なることがあります
| 目次 | |||
| 本線 | 方南町支線 | ||
| 荻窪 | M01 | |
| ・ | ||
| 南阿佐ケ谷 | M02 | |
| ・ | ||
| 新高円寺 | M03 | |
| ・ | ||
| 東高円寺 | M04 | |
| ・ | ||
| 新中野 | M05 | |
| ・ | ||
| 中野坂上 | M06 | 方南町支線▶ |
| ・ | ||
| 西新宿 | M07 | |
| ・ | ||
| 新宿 | M08 | |
| ・ | ||
| 新宿三丁目 | M09 | |
| ・ | ||
| 新宿御苑前 | M10 | |
| ・ | ||
| 四谷三丁目 | M11 | |
| ・ | ||
| 四ツ谷 | M12 | |
| ・ | ||
| 赤坂見附 | M13 | |
| ・ | ||
| 国会議事堂前 | M14 | |
| ・ | ||
| 霞ケ関 | M15 | |
| ・ | ||
| 銀座 | M16 | |
| ・ | ||
| 東京 | M17 | |
| ・ | ||
| 大手町 | M18 | |
| ・ | ||
| 淡路町 | M19 | |
| ・ | ||
| 御茶ノ水 | M20 | |
| ・ | ||
| 本郷三丁目 | M21 | |
| ・ | ||
| 後楽園 | M22 | |
| ・ | ||
| 茗荷谷 | M23 | |
| ・ | ||
| 新大塚 | M24 | |
| ・ | ||
| 池袋 | M25 |
| ▲丸ノ内線 | |
| 中野坂上 | M06 |
| ・ | |
| 中野新橋 | Mb05 |
| ・ | |
| 中野富士見町 | Mb04 |
| ・ | |
| 方南町 | Mb03 |